樹木褐根病在台灣為一古老病害，遠於1928年日據時代，隸屬於總督府中央農業試驗所之真菌學者，澤田兼吉（Kaneyoshi Sawada）即已記敘此病於龍眼、金露花、黃梔花、裂瓣朱槿、繡球花、茄冬、樟樹、變葉木、虱母子草等植物之發生、為害，其後至今之調查顯示，此病在台灣以及離島，多達120種以上之植物寄主被發現，此病隨機分布、多點感染，主要傳播途徑係藉由根系接觸，發病慢、傳播慢、早期病徵不明顯，難以診斷，而後期防治又難以成功，為其特徵。
樹木褐根病經由平面或立體之大眾媒體之鉅量傳播，以及無數褐根病後期診斷、鑑定講習班之講習、推廣，其實已是家喻戶曉、深入人心之全民教育，褐根病目前被認為是台灣或離島，平地海拔1,000公尺以下，林木、果樹或觀賞植物之「世紀黑死病」。
褐根病之防治方法，雖有多種被提及，但目前廣為推行之處理方式為「邁隆（Dazomet）」在罹病植株移除後之大量施用燻蒸，以及再種植前之「再燻蒸」。爰美國環境保護署（Environmental Protection Agency）在2008年7月10日，於紅皮書（Red Fact Sheet）開宗明義即已指出「邁隆」為廣泛性殺生劑（biocide），可用以殺滅真菌、細菌、藻類、線蟲，甚至雜草；而主要殺生機制在其於土壤施用，加水分解後，產生具高揮發性、殺生性之methyl isothiocyanate（MITC），但若吸入或接觸MITC，皆會刺激眼睛，對呼吸系統造成不良影響，此外，亦為皮膚之致過敏原，對於無保護之哺乳類、鳥類、水棲生物，暴露於「邁隆」亦為劇毒。
2011年6月4日，以及7月26日，台北平面媒體，分別以顯著之標題報導「市府4年砸1億，卻擋不住褐根病，束手無策？」，以及「褐根病蔓延，大安森林公園拉警報」；其他各縣市政府，亦應有類似經驗。顯然，廣泛性施用「邁隆」燻蒸處理，徒勞無功，無法滅絕褐根病菌。目前所推薦之防治方法，長久持續大量施用燻蒸劑，衍生抗藥性之褐根病菌菌系勢所難免，而且對生態系破壞性高，對於人、畜、野生物、微生物多樣性之滅絕之負面作用不容忽視，更何況也不符防治成本效益，且不符具深根系、廣根系特性林木之病害防治原則。此外，也和國家所標榜之無毒島、有機農業、生態永續經營之理想、願景背道而馳，亦和地球村之綠色環保之趨勢大相逕庭。
樹木感染褐根病由侵染至顯現明顯病徵，通常費時5-15年，此時60% - 80%以上之根部組織皆已被殖據、分解，此時縱然於根圈土壤施用石灰、尿素，以及其他殺菌劑，通常回天乏術，無法獲得防治成效；倘若以系統性殺菌劑進行根、莖基部點滴灌注，可藉擴散或輸導作用，反而較易達到觸殺病原效果。職是之故，對於珍貴樹種或老樹先行施以預防性藥劑灌注，或定期以靈敏之分子標記進行檢測，驗證有病原存在時，立即進行藥劑灌注，應可事倍功半，並減少成本，以及藥劑對於根圈土壤之汙染和對生態系之破壞。
現行樹木褐根病防治標準作業流程，亦推薦水淹沒法，然於自然林地，就罹病林木或已枯死之林木長期浸水處理，常受水源、地貌、地質所限，通常難以執行，此外，於林地浸水處理成效亦未經驗證；倘若處理對象為尚未枯死之林木，長期浸水，就學理而言，亦不利於林木生長，很可能導致根系缺氧、窒息，或遭受其他喜濕性之卵菌病原侵染，而加速其死亡。
真菌，包括樹木褐根病菌（Phellinus noxius），及層根腐病菌（Phellinus werii），皆係經地球之長期生態選汰、演化後，可適應之棲息物種（inhabitants），前者盛行於熱帶、亞熱帶，而後者則盛行於溫帶、寒帶，故不論於感染林木、果樹、觀賞植物，皆呈分散、點狀分布，或於人工純林之感染中心往外擴散；故生態條件適合時，造成發病、感染，此純屬必然；就此原則衡量，事實上無法滅絕此褐根病之病原，只能由樹種、栽培、管理、經營等途徑，降低發病率，經由物種自然演替，維持生態系多樣性平衡。基於上述，將所獲致之結論和建議陳述於下：
• 樹木高齡化自然枯死、環境逆境壓力、其他根系病原、或其他根系病原和褐根病菌複合感染，因而導致樹木之枯萎，皆需加以釐清，以免誤診。
• 褐根病病原菌殘存於根系，故徹底清除殘留根部組織，植穴中長期（3-6個月）陽光曝曬、乾燥根域，即可減少感染源，並降低其感染潛勢，再強化生態復育，即有利於病害蔓延之遏止。
• 褐根病病原不殘存於土壤，並且樹木根系通常分布既深且廣，故用「邁隆」燻蒸根域土壤不具合理性；再植前之再燻蒸，更不利於再植植物之生長、發育。
• 「邁隆」為廣泛性殺生劑（biocide），會滅絕土壤之微生物，破壞生態，永難恢復。此外，也和國家所標榜之無毒島、有機農業、生態永續經營之理想背道而馳，亦不符地球村之綠色環保趨勢。故「邁隆燻蒸法」之繼續推廣使用，有待商榷。
• 樹木罹患褐根病，於感染中後期呈現明顯病徵，於根圈施用以系統性殺菌劑皆難以收致防治成效。
• 就罹病林木或已於枯死林木之林地長期浸水處理，常受水源、地貌、地質所限，通常難以執行；倘若處理對象為尚未枯死之林木，長期浸水，亦不利於林木生長，且易誘發其他喜濕性病原侵染，更易導致林木枯死。
• 褐根病感染點隨機分佈，阻絕、減絕其感染不易；除根系嫁接傳染外，擔孢子之長距離分散傳播，機率或許不高，但隨著子實體之出現頻率增加，此可能性不能排除，此等更影響「邁隆」之區域性燻蒸，難以收到預期成效。
• 結合早期快速診斷、鑑定、早期治療，以及生態撫育、種植抗病、耐病樹種、合理栽培管理、化學藥劑、生物防治、抗病育種、抗病單株選植等技藝，進行綜合病害管理（Integrated Disease Management，IDM），應為上策。
